TUANKU SYED PUTRA DILANTIK SEBAGAI SERI PADUKA BAGINDA YANG DI PERTUAN AGONG KE 3 PADA 21 SEPTEMBER 1960 KETIKA BERUSIA 40 TAHUN. BAGINDA MERUPAKAN YANG DI PERTUAN AGONG TERMUDA DALAM SEJARAH. BAGINDA DITABALKAN SECARA RASMI PADA 4 JANUARI 1961 DI ISTANA NEGARA KUALA LUMPUR. DI BAWAH PEMERINTAHAN BAGINDA, NEGARA MALAYSIA DITUBUHKAN PADA 16 SEPTEMBER 1963. INI MENJADIKAN BAGINDA SEBAGAI YANG DI PERTUAN AGONG TERAKHIR BAGI PERSEKUTUAN TANAH MELAYU DAN YANG DI PERTUAN AGONG PERTAMA BAGI MALAYSIA. BAGINDA JUGA MERUPAKAN SATU-SATUNYA RAJA BAGI NEGARA SINGAPURA DALAM SEJARAH MODEN.